游戏分为两周目,第一周目是黑子线,第二周目是玩家线,黑子线是游戏的主线剧情,玩家线是游戏的支线剧情。
在黑子线中,许多角色都遭遇了不幸的结局,下面是部分角色在黑子线的命运:
1、茜香:老师重伤后的第二天,茜香下班路上被头盔团袭击,由于没有老师的权限对茜香的行踪进行追踪,茜香彻底失踪,被头盔团用火车运到沙漠深处,被黑服进行实验。
2、星野:为了解决债务问题,星野接受了黑服的条件,辞退学生会副会长职位,签订协议,成为了黑服实验的牺牲品,最后被白子找到时,光环已经破碎。
3、绫音:在战斗中,绫音身受重伤,不得不靠装置维持生命,在看不到希望的情况下,绫音擅自摘掉维生装置了结了自己的生命。
4、野宫:在得知星野死亡后,野宫深受打击,离开阿拜多斯,只身前往沙漠,最后消失在沙漠中,连随身携带的金卡也落在沙漠中。
5、渚、未花:伊甸园条约事件,未花发动政变时所用的炸弹杀死了渚,黑化成了魔女。
6、圣娅:圣娅被多目女在清醒梦中袭击,接触到了“色彩”,最后内在被“色彩”解构,没有能找到逃脱之法,彻底无法苏醒,光环也随之消失。
7、亚津子、梓:梓袭击阿乌里斯小队成功,炸死了亚津子。
8、纱织:纱织被多目女献祭,多目女成功让自身化身为“崇高”。
9、美咲、日奈:美咲割腕自杀再无人阻挡,日奈不堪重伤牺牲。